Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
USP5P45974 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP5P45974 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP5P45974 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP5P45974 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP5P45974 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP5P45974 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP5P45974 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP5P45974 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP5P45974 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP5P45974 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP5P45974 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP5P45974 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP5P45974 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP5P45974 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP5P45974 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP5P45974 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP5P45974 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP5P45974 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP5P45974 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP5P45974 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP5P45974 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
USP5P45974 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP5P45974 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP5P45974 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
USP5P45974 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP5P45974 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP5P45974 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP5P45974 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP5P45974 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP5P45974 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP5P45974 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP5P45974 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP5P45974 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP5P45974 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP5P45974 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP5P45974 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
USP5P45974 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP5P45974 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP5P45974 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP5P45974 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP5P45974 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP5P45974 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP5P45974 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP5P45974 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP5P45974 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP5P45974 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
USP5P45974 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP5P45974 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP5P45974 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP5P45974 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP5P45974 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP5P45974 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP5P45974 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP5P45974 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP5P45974 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP5P45974 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP5P45974 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
USP5P45974 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP5P45974 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP5P45974 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
USP5P45974 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP5P45974 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP5P45974 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
USP5P45974 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP5P45974 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP5P45974 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP5P45974 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP5P45974 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP5P45974 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP5P45974 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP5P45974 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP5P45974 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP5P45974 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP5P45974 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP5P45974 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP5P45974 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP5P45974 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP5P45974 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP5P45974 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP5P45974 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP5P45974 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP5P45974 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP5P45974 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP5P45974 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP5P45974 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP5P45974 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP5P45974 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
USP5P45974 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP5P45974 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP5P45974 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP5P45974 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP5P45974 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP5P45974 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP5P45974 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP5P45974 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
USP5P45974 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
USP5P45974 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP5P45974 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP5P45974 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms