Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GGCXP38435 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GGCXP38435 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GGCXP38435 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GGCXP38435 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GGCXP38435 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GGCXP38435 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GGCXP38435 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GGCXP38435 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GGCXP38435 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GGCXP38435 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GGCXP38435 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GGCXP38435 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GGCXP38435 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GGCXP38435 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GGCXP38435 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GGCXP38435 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GGCXP38435 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GGCXP38435 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GGCXP38435 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GGCXP38435 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GGCXP38435 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GGCXP38435 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GGCXP38435 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GGCXP38435 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GGCXP38435 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GGCXP38435 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GGCXP38435 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GGCXP38435 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GGCXP38435 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GGCXP38435 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GGCXP38435 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GGCXP38435 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GGCXP38435 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GGCXP38435 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GGCXP38435 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GGCXP38435 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GGCXP38435 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GGCXP38435 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GGCXP38435 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GGCXP38435 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GGCXP38435 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GGCXP38435 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GGCXP38435 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GGCXP38435 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GGCXP38435 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GGCXP38435 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GGCXP38435 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GGCXP38435 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GGCXP38435 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GGCXP38435 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GGCXP38435 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GGCXP38435 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGCXP38435 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGCXP38435 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGCXP38435 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGCXP38435 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGCXP38435 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGCXP38435 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGCXP38435 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGCXP38435 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGCXP38435 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GGCXP38435 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGCXP38435 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGCXP38435 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGCXP38435 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGCXP38435 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGCXP38435 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGCXP38435 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGCXP38435 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGCXP38435 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGCXP38435 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGCXP38435 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGCXP38435 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGCXP38435 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGCXP38435 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGCXP38435 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGCXP38435 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGCXP38435 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGCXP38435 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGCXP38435 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGCXP38435 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGCXP38435 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGCXP38435 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGCXP38435 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGCXP38435 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGCXP38435 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGCXP38435 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGCXP38435 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGCXP38435 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGCXP38435 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGCXP38435 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGCXP38435 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGCXP38435 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGCXP38435 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGCXP38435 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGCXP38435 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GGCXP38435 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGCXP38435 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGCXP38435 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms