Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms