Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms