Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms