Protein–RNA interactions for Protein: P29376

LTK, Leukocyte tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTKP29376 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTKP29376 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTKP29376 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LTKP29376 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LTKP29376 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LTKP29376 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTKP29376 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTKP29376 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTKP29376 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTKP29376 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTKP29376 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTKP29376 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTKP29376 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTKP29376 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTKP29376 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTKP29376 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LTKP29376 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTKP29376 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTKP29376 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTKP29376 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LTKP29376 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTKP29376 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTKP29376 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTKP29376 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTKP29376 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTKP29376 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTKP29376 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTKP29376 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTKP29376 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTKP29376 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTKP29376 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTKP29376 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTKP29376 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTKP29376 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTKP29376 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTKP29376 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTKP29376 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTKP29376 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTKP29376 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTKP29376 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LTKP29376 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTKP29376 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTKP29376 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LTKP29376 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LTKP29376 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTKP29376 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTKP29376 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTKP29376 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LTKP29376 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTKP29376 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LTKP29376 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTKP29376 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTKP29376 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTKP29376 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTKP29376 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTKP29376 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTKP29376 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTKP29376 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTKP29376 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTKP29376 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTKP29376 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTKP29376 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LTKP29376 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTKP29376 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LTKP29376 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LTKP29376 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LTKP29376 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTKP29376 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTKP29376 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTKP29376 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTKP29376 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTKP29376 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTKP29376 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LTKP29376 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTKP29376 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTKP29376 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTKP29376 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTKP29376 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTKP29376 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTKP29376 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTKP29376 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTKP29376 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTKP29376 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTKP29376 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTKP29376 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTKP29376 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LTKP29376 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTKP29376 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTKP29376 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTKP29376 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTKP29376 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTKP29376 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTKP29376 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LTKP29376 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTKP29376 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTKP29376 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTKP29376 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTKP29376 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTKP29376 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LTKP29376 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms