Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCAP28676 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCAP28676 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCAP28676 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCAP28676 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCAP28676 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCAP28676 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCAP28676 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCAP28676 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GCAP28676 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCAP28676 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCAP28676 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCAP28676 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCAP28676 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GCAP28676 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCAP28676 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCAP28676 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCAP28676 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCAP28676 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCAP28676 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCAP28676 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCAP28676 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCAP28676 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCAP28676 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCAP28676 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCAP28676 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCAP28676 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCAP28676 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCAP28676 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCAP28676 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCAP28676 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCAP28676 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCAP28676 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCAP28676 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GCAP28676 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCAP28676 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCAP28676 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCAP28676 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCAP28676 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCAP28676 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCAP28676 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCAP28676 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCAP28676 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCAP28676 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCAP28676 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCAP28676 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCAP28676 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCAP28676 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCAP28676 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCAP28676 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCAP28676 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCAP28676 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCAP28676 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GCAP28676 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCAP28676 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GCAP28676 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCAP28676 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCAP28676 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCAP28676 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCAP28676 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GCAP28676 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCAP28676 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCAP28676 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCAP28676 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCAP28676 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCAP28676 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCAP28676 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCAP28676 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCAP28676 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCAP28676 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCAP28676 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCAP28676 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCAP28676 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCAP28676 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GCAP28676 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCAP28676 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCAP28676 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCAP28676 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCAP28676 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCAP28676 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCAP28676 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCAP28676 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCAP28676 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCAP28676 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCAP28676 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GCAP28676 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCAP28676 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCAP28676 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCAP28676 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCAP28676 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GCAP28676 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCAP28676 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCAP28676 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCAP28676 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCAP28676 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCAP28676 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCAP28676 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCAP28676 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCAP28676 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCAP28676 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms