Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PEX2P28328 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PEX2P28328 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PEX2P28328 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PEX2P28328 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PEX2P28328 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PEX2P28328 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PEX2P28328 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PEX2P28328 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PEX2P28328 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PEX2P28328 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PEX2P28328 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PEX2P28328 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PEX2P28328 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PEX2P28328 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PEX2P28328 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PEX2P28328 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PEX2P28328 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PEX2P28328 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PEX2P28328 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PEX2P28328 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PEX2P28328 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PEX2P28328 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PEX2P28328 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
PEX2P28328 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PEX2P28328 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PEX2P28328 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PEX2P28328 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PEX2P28328 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PEX2P28328 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PEX2P28328 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PEX2P28328 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PEX2P28328 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PEX2P28328 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PEX2P28328 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PEX2P28328 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PEX2P28328 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PEX2P28328 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PEX2P28328 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PEX2P28328 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PEX2P28328 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PEX2P28328 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PEX2P28328 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PEX2P28328 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PEX2P28328 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PEX2P28328 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PEX2P28328 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PEX2P28328 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PEX2P28328 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PEX2P28328 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PEX2P28328 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PEX2P28328 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PEX2P28328 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PEX2P28328 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX2P28328 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX2P28328 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX2P28328 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX2P28328 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX2P28328 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX2P28328 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX2P28328 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX2P28328 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX2P28328 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX2P28328 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX2P28328 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX2P28328 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX2P28328 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX2P28328 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX2P28328 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX2P28328 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX2P28328 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX2P28328 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX2P28328 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX2P28328 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX2P28328 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX2P28328 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX2P28328 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX2P28328 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX2P28328 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX2P28328 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX2P28328 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX2P28328 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX2P28328 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX2P28328 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX2P28328 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX2P28328 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX2P28328 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX2P28328 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX2P28328 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX2P28328 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX2P28328 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX2P28328 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX2P28328 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX2P28328 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX2P28328 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX2P28328 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX2P28328 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX2P28328 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX2P28328 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PEX2P28328 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms