Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms