Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1P21675 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1P21675 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1P21675 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1P21675 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1P21675 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1P21675 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1P21675 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1P21675 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF1P21675 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF1P21675 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF1P21675 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF1P21675 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF1P21675 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF1P21675 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF1P21675 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF1P21675 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF1P21675 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF1P21675 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF1P21675 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF1P21675 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF1P21675 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF1P21675 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF1P21675 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF1P21675 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF1P21675 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF1P21675 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TAF1P21675 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TAF1P21675 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
TAF1P21675 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
TAF1P21675 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
TAF1P21675 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TAF1P21675 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TAF1P21675 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TAF1P21675 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TAF1P21675 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TAF1P21675 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TAF1P21675 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TAF1P21675 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TAF1P21675 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1P21675 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1P21675 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1P21675 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1P21675 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1P21675 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1P21675 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1P21675 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1P21675 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1P21675 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1P21675 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1P21675 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1P21675 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1P21675 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1P21675 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1P21675 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1P21675 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1P21675 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1P21675 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1P21675 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1P21675 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1P21675 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1P21675 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1P21675 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1P21675 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1P21675 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1P21675 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1P21675 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1P21675 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1P21675 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1P21675 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1P21675 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1P21675 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1P21675 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1P21675 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1P21675 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1P21675 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1P21675 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1P21675 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1P21675 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1P21675 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1P21675 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1P21675 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1P21675 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1P21675 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1P21675 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1P21675 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1P21675 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1P21675 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1P21675 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1P21675 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1P21675 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1P21675 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1P21675 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1P21675 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1P21675 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1P21675 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1P21675 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1P21675 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1P21675 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1P21675 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms