Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms