Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDSP20132 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDSP20132 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDSP20132 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SDSP20132 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDSP20132 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SDSP20132 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDSP20132 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SDSP20132 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SDSP20132 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SDSP20132 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SDSP20132 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDSP20132 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDSP20132 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDSP20132 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDSP20132 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDSP20132 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDSP20132 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDSP20132 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDSP20132 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDSP20132 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDSP20132 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDSP20132 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDSP20132 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDSP20132 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDSP20132 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDSP20132 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDSP20132 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDSP20132 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDSP20132 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDSP20132 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDSP20132 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDSP20132 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDSP20132 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDSP20132 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDSP20132 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDSP20132 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDSP20132 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDSP20132 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDSP20132 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDSP20132 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDSP20132 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDSP20132 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDSP20132 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDSP20132 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDSP20132 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDSP20132 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDSP20132 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDSP20132 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SDSP20132 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDSP20132 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDSP20132 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDSP20132 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDSP20132 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SDSP20132 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SDSP20132 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SDSP20132 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SDSP20132 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SDSP20132 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SDSP20132 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDSP20132 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDSP20132 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDSP20132 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDSP20132 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDSP20132 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDSP20132 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDSP20132 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDSP20132 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDSP20132 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDSP20132 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDSP20132 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDSP20132 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SDSP20132 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDSP20132 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDSP20132 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDSP20132 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDSP20132 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDSP20132 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SDSP20132 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDSP20132 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDSP20132 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDSP20132 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDSP20132 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDSP20132 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDSP20132 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDSP20132 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDSP20132 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDSP20132 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDSP20132 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDSP20132 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDSP20132 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDSP20132 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDSP20132 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDSP20132 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SDSP20132 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDSP20132 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDSP20132 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDSP20132 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDSP20132 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDSP20132 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms