Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCC1P18754 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCC1P18754 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCC1P18754 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RCC1P18754 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCC1P18754 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCC1P18754 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCC1P18754 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCC1P18754 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCC1P18754 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RCC1P18754 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCC1P18754 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCC1P18754 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCC1P18754 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCC1P18754 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RCC1P18754 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCC1P18754 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCC1P18754 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCC1P18754 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCC1P18754 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCC1P18754 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCC1P18754 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCC1P18754 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCC1P18754 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCC1P18754 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCC1P18754 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCC1P18754 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCC1P18754 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCC1P18754 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCC1P18754 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCC1P18754 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCC1P18754 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCC1P18754 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCC1P18754 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCC1P18754 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCC1P18754 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCC1P18754 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCC1P18754 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCC1P18754 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCC1P18754 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCC1P18754 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCC1P18754 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCC1P18754 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCC1P18754 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RCC1P18754 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCC1P18754 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCC1P18754 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RCC1P18754 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCC1P18754 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCC1P18754 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCC1P18754 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCC1P18754 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCC1P18754 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCC1P18754 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCC1P18754 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCC1P18754 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCC1P18754 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCC1P18754 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCC1P18754 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCC1P18754 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCC1P18754 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCC1P18754 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCC1P18754 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCC1P18754 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RCC1P18754 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCC1P18754 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCC1P18754 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCC1P18754 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCC1P18754 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCC1P18754 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCC1P18754 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCC1P18754 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCC1P18754 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCC1P18754 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCC1P18754 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCC1P18754 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCC1P18754 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCC1P18754 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCC1P18754 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCC1P18754 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCC1P18754 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCC1P18754 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCC1P18754 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCC1P18754 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCC1P18754 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCC1P18754 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCC1P18754 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCC1P18754 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCC1P18754 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCC1P18754 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCC1P18754 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCC1P18754 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCC1P18754 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCC1P18754 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCC1P18754 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RCC1P18754 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCC1P18754 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCC1P18754 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCC1P18754 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCC1P18754 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms