Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTRB1P17538 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTRB1P17538 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTRB1P17538 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTRB1P17538 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTRB1P17538 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTRB1P17538 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTRB1P17538 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTRB1P17538 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTRB1P17538 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTRB1P17538 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTRB1P17538 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTRB1P17538 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTRB1P17538 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTRB1P17538 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTRB1P17538 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTRB1P17538 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTRB1P17538 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTRB1P17538 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CTRB1P17538 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTRB1P17538 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTRB1P17538 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTRB1P17538 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTRB1P17538 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTRB1P17538 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CTRB1P17538 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTRB1P17538 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CTRB1P17538 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTRB1P17538 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CTRB1P17538 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTRB1P17538 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTRB1P17538 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTRB1P17538 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTRB1P17538 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTRB1P17538 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTRB1P17538 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTRB1P17538 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTRB1P17538 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTRB1P17538 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTRB1P17538 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTRB1P17538 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTRB1P17538 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTRB1P17538 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTRB1P17538 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTRB1P17538 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTRB1P17538 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTRB1P17538 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTRB1P17538 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTRB1P17538 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTRB1P17538 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTRB1P17538 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTRB1P17538 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CTRB1P17538 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTRB1P17538 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTRB1P17538 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTRB1P17538 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTRB1P17538 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTRB1P17538 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CTRB1P17538 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTRB1P17538 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTRB1P17538 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CTRB1P17538 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTRB1P17538 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CTRB1P17538 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTRB1P17538 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTRB1P17538 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTRB1P17538 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTRB1P17538 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTRB1P17538 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTRB1P17538 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTRB1P17538 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTRB1P17538 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTRB1P17538 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTRB1P17538 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTRB1P17538 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTRB1P17538 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTRB1P17538 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTRB1P17538 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTRB1P17538 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTRB1P17538 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTRB1P17538 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTRB1P17538 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTRB1P17538 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTRB1P17538 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTRB1P17538 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTRB1P17538 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTRB1P17538 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTRB1P17538 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTRB1P17538 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTRB1P17538 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTRB1P17538 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CTRB1P17538 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTRB1P17538 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTRB1P17538 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTRB1P17538 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTRB1P17538 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTRB1P17538 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTRB1P17538 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTRB1P17538 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTRB1P17538 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms