Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-EP13747 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms