Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGA4P13612 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms