Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms