Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms