Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJB1P08034 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJB1P08034 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJB1P08034 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJB1P08034 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJB1P08034 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJB1P08034 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJB1P08034 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJB1P08034 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJB1P08034 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJB1P08034 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJB1P08034 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJB1P08034 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJB1P08034 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GJB1P08034 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJB1P08034 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJB1P08034 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJB1P08034 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJB1P08034 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJB1P08034 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJB1P08034 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJB1P08034 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJB1P08034 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJB1P08034 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJB1P08034 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJB1P08034 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJB1P08034 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GJB1P08034 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJB1P08034 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJB1P08034 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJB1P08034 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJB1P08034 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJB1P08034 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJB1P08034 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJB1P08034 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJB1P08034 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJB1P08034 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GJB1P08034 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJB1P08034 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJB1P08034 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJB1P08034 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJB1P08034 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJB1P08034 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GJB1P08034 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJB1P08034 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJB1P08034 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJB1P08034 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJB1P08034 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJB1P08034 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJB1P08034 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJB1P08034 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJB1P08034 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJB1P08034 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJB1P08034 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJB1P08034 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GJB1P08034 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJB1P08034 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJB1P08034 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJB1P08034 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJB1P08034 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJB1P08034 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJB1P08034 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJB1P08034 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJB1P08034 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJB1P08034 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GJB1P08034 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJB1P08034 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJB1P08034 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJB1P08034 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJB1P08034 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJB1P08034 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJB1P08034 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJB1P08034 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJB1P08034 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJB1P08034 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJB1P08034 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJB1P08034 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJB1P08034 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB1P08034 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB1P08034 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB1P08034 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB1P08034 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB1P08034 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB1P08034 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB1P08034 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB1P08034 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB1P08034 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB1P08034 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB1P08034 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB1P08034 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB1P08034 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB1P08034 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB1P08034 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB1P08034 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB1P08034 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB1P08034 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB1P08034 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB1P08034 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB1P08034 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB1P08034 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms