Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEFMP07197 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEFMP07197 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEFMP07197 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEFMP07197 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEFMP07197 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEFMP07197 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEFMP07197 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEFMP07197 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEFMP07197 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEFMP07197 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEFMP07197 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEFMP07197 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEFMP07197 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEFMP07197 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEFMP07197 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEFMP07197 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEFMP07197 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEFMP07197 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEFMP07197 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEFMP07197 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFMP07197 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFMP07197 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFMP07197 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFMP07197 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFMP07197 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFMP07197 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFMP07197 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFMP07197 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFMP07197 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFMP07197 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFMP07197 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFMP07197 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFMP07197 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFMP07197 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFMP07197 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFMP07197 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFMP07197 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFMP07197 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFMP07197 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFMP07197 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFMP07197 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFMP07197 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFMP07197 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFMP07197 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFMP07197 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFMP07197 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFMP07197 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFMP07197 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFMP07197 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFMP07197 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFMP07197 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFMP07197 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFMP07197 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFMP07197 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFMP07197 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFMP07197 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFMP07197 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFMP07197 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFMP07197 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFMP07197 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFMP07197 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFMP07197 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFMP07197 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFMP07197 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFMP07197 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFMP07197 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFMP07197 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFMP07197 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFMP07197 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFMP07197 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFMP07197 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFMP07197 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFMP07197 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFMP07197 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFMP07197 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFMP07197 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFMP07197 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFMP07197 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFMP07197 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFMP07197 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFMP07197 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFMP07197 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFMP07197 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFMP07197 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFMP07197 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFMP07197 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFMP07197 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFMP07197 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFMP07197 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFMP07197 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFMP07197 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFMP07197 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFMP07197 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFMP07197 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFMP07197 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFMP07197 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFMP07197 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFMP07197 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFMP07197 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms