Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA1P02647 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA1P02647 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA1P02647 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA1P02647 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA1P02647 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA1P02647 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA1P02647 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA1P02647 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA1P02647 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA1P02647 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA1P02647 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA1P02647 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA1P02647 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA1P02647 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA1P02647 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA1P02647 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA1P02647 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA1P02647 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA1P02647 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA1P02647 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA1P02647 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA1P02647 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA1P02647 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA1P02647 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA1P02647 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA1P02647 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA1P02647 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA1P02647 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA1P02647 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA1P02647 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA1P02647 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA1P02647 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA1P02647 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA1P02647 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA1P02647 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA1P02647 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA1P02647 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA1P02647 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA1P02647 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA1P02647 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA1P02647 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA1P02647 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOA1P02647 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
APOA1P02647 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOA1P02647 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOA1P02647 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOA1P02647 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOA1P02647 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOA1P02647 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOA1P02647 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOA1P02647 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOA1P02647 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOA1P02647 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOA1P02647 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOA1P02647 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOA1P02647 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOA1P02647 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOA1P02647 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOA1P02647 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOA1P02647 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOA1P02647 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOA1P02647 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
APOA1P02647 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOA1P02647 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOA1P02647 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOA1P02647 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOA1P02647 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOA1P02647 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOA1P02647 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOA1P02647 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOA1P02647 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOA1P02647 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOA1P02647 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOA1P02647 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOA1P02647 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOA1P02647 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
APOA1P02647 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOA1P02647 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOA1P02647 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOA1P02647 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOA1P02647 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOA1P02647 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOA1P02647 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOA1P02647 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOA1P02647 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOA1P02647 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOA1P02647 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOA1P02647 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOA1P02647 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOA1P02647 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOA1P02647 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA1P02647 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA1P02647 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA1P02647 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA1P02647 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA1P02647 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA1P02647 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA1P02647 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA1P02647 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms