Protein–RNA interactions for Protein: P01036

CST4, Cystatin-S, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST4P01036 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CST4P01036 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CST4P01036 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CST4P01036 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CST4P01036 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CST4P01036 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CST4P01036 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CST4P01036 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CST4P01036 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CST4P01036 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CST4P01036 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CST4P01036 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CST4P01036 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CST4P01036 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CST4P01036 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CST4P01036 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CST4P01036 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CST4P01036 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CST4P01036 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CST4P01036 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CST4P01036 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CST4P01036 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CST4P01036 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CST4P01036 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CST4P01036 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CST4P01036 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CST4P01036 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CST4P01036 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CST4P01036 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CST4P01036 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CST4P01036 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CST4P01036 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CST4P01036 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CST4P01036 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CST4P01036 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CST4P01036 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CST4P01036 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CST4P01036 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CST4P01036 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CST4P01036 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CST4P01036 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CST4P01036 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CST4P01036 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CST4P01036 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CST4P01036 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CST4P01036 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CST4P01036 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CST4P01036 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CST4P01036 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CST4P01036 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CST4P01036 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CST4P01036 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CST4P01036 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CST4P01036 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CST4P01036 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CST4P01036 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CST4P01036 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CST4P01036 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CST4P01036 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CST4P01036 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CST4P01036 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CST4P01036 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CST4P01036 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CST4P01036 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CST4P01036 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CST4P01036 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CST4P01036 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CST4P01036 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CST4P01036 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CST4P01036 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CST4P01036 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CST4P01036 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CST4P01036 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CST4P01036 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CST4P01036 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CST4P01036 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CST4P01036 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CST4P01036 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CST4P01036 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CST4P01036 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CST4P01036 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CST4P01036 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CST4P01036 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CST4P01036 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CST4P01036 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CST4P01036 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CST4P01036 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CST4P01036 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CST4P01036 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CST4P01036 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CST4P01036 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CST4P01036 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CST4P01036 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CST4P01036 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CST4P01036 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CST4P01036 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CST4P01036 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CST4P01036 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CST4P01036 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CST4P01036 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms