Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZBED1O96006 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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