Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRATO95237 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRATO95237 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRATO95237 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRATO95237 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRATO95237 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRATO95237 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRATO95237 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRATO95237 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRATO95237 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRATO95237 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRATO95237 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRATO95237 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRATO95237 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRATO95237 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRATO95237 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRATO95237 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LRATO95237 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRATO95237 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRATO95237 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRATO95237 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRATO95237 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LRATO95237 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRATO95237 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRATO95237 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRATO95237 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LRATO95237 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LRATO95237 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LRATO95237 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LRATO95237 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LRATO95237 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRATO95237 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRATO95237 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRATO95237 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRATO95237 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRATO95237 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRATO95237 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRATO95237 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRATO95237 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRATO95237 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRATO95237 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRATO95237 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRATO95237 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRATO95237 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRATO95237 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRATO95237 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRATO95237 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRATO95237 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRATO95237 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRATO95237 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRATO95237 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRATO95237 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LRATO95237 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRATO95237 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRATO95237 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRATO95237 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRATO95237 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRATO95237 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRATO95237 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRATO95237 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRATO95237 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRATO95237 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRATO95237 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRATO95237 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRATO95237 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRATO95237 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRATO95237 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRATO95237 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRATO95237 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRATO95237 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRATO95237 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRATO95237 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRATO95237 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRATO95237 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LRATO95237 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRATO95237 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRATO95237 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRATO95237 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRATO95237 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRATO95237 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRATO95237 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRATO95237 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LRATO95237 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRATO95237 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRATO95237 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRATO95237 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRATO95237 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRATO95237 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRATO95237 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRATO95237 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRATO95237 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRATO95237 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRATO95237 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LRATO95237 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRATO95237 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LRATO95237 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRATO95237 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRATO95237 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRATO95237 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRATO95237 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms