Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCATO75600 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCATO75600 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCATO75600 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCATO75600 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCATO75600 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCATO75600 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCATO75600 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCATO75600 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCATO75600 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCATO75600 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCATO75600 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCATO75600 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCATO75600 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCATO75600 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCATO75600 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCATO75600 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GCATO75600 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCATO75600 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCATO75600 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GCATO75600 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCATO75600 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCATO75600 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCATO75600 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCATO75600 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCATO75600 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GCATO75600 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCATO75600 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCATO75600 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCATO75600 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCATO75600 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCATO75600 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GCATO75600 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCATO75600 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCATO75600 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCATO75600 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GCATO75600 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCATO75600 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCATO75600 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCATO75600 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCATO75600 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCATO75600 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCATO75600 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCATO75600 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCATO75600 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCATO75600 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCATO75600 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCATO75600 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCATO75600 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCATO75600 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCATO75600 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GCATO75600 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCATO75600 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCATO75600 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCATO75600 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GCATO75600 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCATO75600 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCATO75600 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCATO75600 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCATO75600 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCATO75600 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCATO75600 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCATO75600 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCATO75600 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCATO75600 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCATO75600 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCATO75600 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCATO75600 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCATO75600 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCATO75600 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCATO75600 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCATO75600 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCATO75600 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCATO75600 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCATO75600 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCATO75600 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCATO75600 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCATO75600 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCATO75600 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCATO75600 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCATO75600 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GCATO75600 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCATO75600 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCATO75600 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCATO75600 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCATO75600 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCATO75600 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCATO75600 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCATO75600 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCATO75600 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GCATO75600 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GCATO75600 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GCATO75600 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCATO75600 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCATO75600 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCATO75600 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCATO75600 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCATO75600 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCATO75600 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCATO75600 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms