Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms