Protein–RNA interactions for Protein: O60279

SUSD5, Sushi domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD5O60279 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms