Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP9BO43861 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP9BO43861 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP9BO43861 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP9BO43861 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP9BO43861 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP9BO43861 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP9BO43861 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP9BO43861 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP9BO43861 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP9BO43861 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP9BO43861 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP9BO43861 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP9BO43861 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP9BO43861 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP9BO43861 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP9BO43861 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP9BO43861 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP9BO43861 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP9BO43861 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP9BO43861 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP9BO43861 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP9BO43861 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP9BO43861 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP9BO43861 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP9BO43861 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP9BO43861 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP9BO43861 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP9BO43861 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP9BO43861 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP9BO43861 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP9BO43861 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP9BO43861 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP9BO43861 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP9BO43861 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP9BO43861 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP9BO43861 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP9BO43861 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP9BO43861 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP9BO43861 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP9BO43861 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP9BO43861 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP9BO43861 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms