Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms