Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPAA1O43292 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms