Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
AGRNO00468 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
AGRNO00468 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
AGRNO00468 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
AGRNO00468 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
AGRNO00468 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
AGRNO00468 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
AGRNO00468 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
AGRNO00468 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
AGRNO00468 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
AGRNO00468 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
AGRNO00468 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
AGRNO00468 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
AGRNO00468 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AGRNO00468 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AGRNO00468 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AGRNO00468 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AGRNO00468 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AGRNO00468 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AGRNO00468 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AGRNO00468 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AGRNO00468 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AGRNO00468 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AGRNO00468 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AGRNO00468 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AGRNO00468 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AGRNO00468 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AGRNO00468 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AGRNO00468 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AGRNO00468 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AGRNO00468 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AGRNO00468 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AGRNO00468 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AGRNO00468 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AGRNO00468 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AGRNO00468 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AGRNO00468 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AGRNO00468 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AGRNO00468 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AGRNO00468 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AGRNO00468 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AGRNO00468 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AGRNO00468 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AGRNO00468 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AGRNO00468 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AGRNO00468 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AGRNO00468 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AGRNO00468 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AGRNO00468 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AGRNO00468 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AGRNO00468 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AGRNO00468 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AGRNO00468 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AGRNO00468 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AGRNO00468 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AGRNO00468 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AGRNO00468 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AGRNO00468 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AGRNO00468 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AGRNO00468 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AGRNO00468 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AGRNO00468 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AGRNO00468 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AGRNO00468 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AGRNO00468 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AGRNO00468 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AGRNO00468 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AGRNO00468 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AGRNO00468 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AGRNO00468 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AGRNO00468 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AGRNO00468 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AGRNO00468 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AGRNO00468 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AGRNO00468 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
AGRNO00468 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AGRNO00468 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AGRNO00468 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AGRNO00468 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AGRNO00468 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AGRNO00468 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
AGRNO00468 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AGRNO00468 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AGRNO00468 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AGRNO00468 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AGRNO00468 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AGRNO00468 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AGRNO00468 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AGRNO00468 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AGRNO00468 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AGRNO00468 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AGRNO00468 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AGRNO00468 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AGRNO00468 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AGRNO00468 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AGRNO00468 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AGRNO00468 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AGRNO00468 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AGRNO00468 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AGRNO00468 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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