Protein–RNA interactions for Protein: E2RYF7

HCG22, Protein PBMUCL2, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG22E2RYF7 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HCG22E2RYF7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms