Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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