Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms