Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms