Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms