Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2N7

HIF3A, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF3AQ9Y2N7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms