Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms