Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms