Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL52

TMPRSS11E, Transmembrane protease serine 11E, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11EQ9UL52 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms