Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSEQ9UL01 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DSEQ9UL01 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DSEQ9UL01 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DSEQ9UL01 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DSEQ9UL01 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DSEQ9UL01 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSEQ9UL01 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSEQ9UL01 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSEQ9UL01 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSEQ9UL01 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSEQ9UL01 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSEQ9UL01 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSEQ9UL01 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSEQ9UL01 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSEQ9UL01 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSEQ9UL01 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSEQ9UL01 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSEQ9UL01 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSEQ9UL01 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSEQ9UL01 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
DSEQ9UL01 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
DSEQ9UL01 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSEQ9UL01 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSEQ9UL01 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms