Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms