Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGV2

NDRG3, Protein NDRG3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG3Q9UGV2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDRG3Q9UGV2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms