Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms