Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms