Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2F8

SIPA1L2, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L2Q9P2F8 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SIPA1L2Q9P2F8 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms