Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HMG20BQ9P0W2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HMG20BQ9P0W2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HMG20BQ9P0W2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HMG20BQ9P0W2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HMG20BQ9P0W2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HMG20BQ9P0W2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HMG20BQ9P0W2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMG20BQ9P0W2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMG20BQ9P0W2 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMG20BQ9P0W2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMG20BQ9P0W2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMG20BQ9P0W2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMG20BQ9P0W2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMG20BQ9P0W2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMG20BQ9P0W2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMG20BQ9P0W2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMG20BQ9P0W2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms