Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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HOXC10Q9NYD6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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HOXC10Q9NYD6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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HOXC10Q9NYD6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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HOXC10Q9NYD6 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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HOXC10Q9NYD6 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXC10Q9NYD6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXC10Q9NYD6 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXC10Q9NYD6 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXC10Q9NYD6 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXC10Q9NYD6 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXC10Q9NYD6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXC10Q9NYD6 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
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