Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX76

CMTM6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6Q9NX76 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM6Q9NX76 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms