Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms